Figyelem, spoilerek következnek. Az alapjáték története egy közepesen nagy fordulattal ért véget, ha emlékszünk, Raynor nagymester megmentette és visszaváltoztatta Kerrigant emberi formájába. Láthatóan azonban mégsem történt minden úgy, ahogy kellett volna: előkerül az elkaszált Starcraft: Ghost főszereplője, Nova, aki Kerriganre vadászik.