Nintendo Wii U-n válthatunk, hogy a tabletkontrolleren vagy TV-n futtatjuk-e a játékot. Utóbbi esetben a GamePad-en a térképet vizslathatjuk, de a különböző képességeinket is itt aktiválhatjuk, miközben csapatunk tagjainak oszthatunk ki parancsokat. A Mass Effect 3 Wii U-s változata a konzol nyitócíme lesz.