A játék úgy kezdődik, hogy az általunk alakított karakter, Jason Brody éppen önfeledten ejtőernyőzik, ám a móka csakhamar véget ér, hiszen összehozza a sors a pszichopata Vaasszal. Innen már túl kell élnünk mindenáron. Nem csupán a természettel kell megküzdenünk, hanem a felbérelt zsoldoshadsereggel is.
Az alábbi videóban megcsodálhatjuk a Vaas táborából való szökés perceit:
Itt pediglen bemutatkozik Dennis és a békés Amanaki falu, azt sugallva felénk, hogy azért vannak barátságos arcok is a szigeten:
Elérjük az előőrsöt:
Végül elmenekülünk a Fehérhomok hotelből: